Photo images, 3D models and CT scanned data of loaches (Botiidae, Cobitidae and Nemacheilidae) of Japan
最新バージョン Biodiversity Data Journal によって公開 2021/08/31 Biodiversity Data Journal

Loach is one of the major cypriniform fishes in freshwater habitats of Japan, being recognized 23 described species/subspecies and 12 undescribed/undecides clades (Nakajima and Uchiyama 2017) (http://ffish.asia/loachesOfJapan). As well as molecular genetic research (Kitagawa et al. 2001a, Kitagawa et al. 2001b, Kitagawa et al. 2003a, Kitagawa et al. 2003b, Kitagawa et al. 2005, Suzawa 2006, Morishima et al. 2008, Saitoh et al. 2010, Kano et al. 2011, Miyazaki et al. 2011, Shimizu et al. 2011, Kano et al. 2012, Nakajima 2012, Nakajima 2016, Nakajima and Suzawa 2016, Nakajima and Uchiyama 2017), morphological examinations are needed for further development of loach study. Digital archiving of fish specimens is one of the progressive challenges in ichthyology for open science (Kanagawa Prefectural Museum of Natural History and National Museum of Nature and Science 1998, Berquist et al. 2012, Kano et al. 2013, Kano et al. 2016). This paper aimed to online publish photo images, 3D models and CT scanned data of all the known taxa/clades of loaches inhabiting in Japan (http://ffish.asia/loachesOfJapan3D) for the advances of loach study and ichthyology, and furthermore as a challenge of open science for public interests of biology.

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データ レコード

この オカレンス（観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、103 レコードが含まれています。

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  • Occurrence (コア)
    103
  • Multimedia 
    309

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引用方法

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Kano Y (2021): Photo images, 3D models and CT scanned data of loaches (Botiidae, Cobitidae and Nemacheilidae) of Japan. v1.9. Biodiversity Data Journal. Dataset/Occurrence. http://ipt.pensoft.net/resource?r=jp_loaches_3dct_models&v=1.9

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Biodiversity Data Journal。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 1570db97-7b8d-4f12-9c3b-10c731460ca6が割り当てられています。   Participant Node Managers Committee によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているBiodiversity Data Journal が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

3D model; Anatomy; Bone; CT scan; Digital archiving; Fish specimen; Freshwater fishes of Japan; GBIF; Holotype; Loach; Morphology; Open science; Paratype; Skeleton; Undescribed species; Inventorythematic

外部データ

リソース データは他の形式で入手可能です。

loachesOfJapan http://ffish.asia/loachesOfJapan UTF-8 html; jpg
loachesOfJapan3D http://ffish.asia/loachesOfJapan3D UTF-8 html; Wavefront object format (.obj); CT dicom file (.dcm)
連絡先

リソースを作成した人:

Yuichi Kano
Associate Professor
Kyushu University
744 Motooka, Nishi-ku
8190395 Fukuoka-shi
Fukuoka
JP
http://fish.asia

リソースに関する質問に答えることができる人:

Yuichi Kano
Associate Professor
Kyushu University
744 Motooka, Nishi-ku
8190395 Fukuoka-shi
Fukuoka
JP
http://fish.asia

メタデータを記載した人:

Yuichi Kano
Associate Professor
Kyushu University
744 Motooka, Nishi-ku
8190395 Fukuoka-shi
Fukuoka
JP
http://fish.asia

他に、リソースに関連付けられていた人:

論文著者
Yuichi Kano
Associate Professor
Kyushu University
744 Motooka, Nishi-ku
8190395 Fukuoka-shi
Fukuoka
JP
http://fish.asia
論文著者
Jun Nakajima
Research Worker
Fukuoka Institute of Health and Environmental Sciences
39 Mukaizano
8180135 Dazaifu
Fukuoka
JP
論文著者
Takeshi Yamasaki
Laboratory Chief
Yamashina Institute for Ornithology, Japan
115 Konoyama
2701145 Abiko-shi
Chiba
JP
論文著者
Jyun-ichi Kitamura
Curator
Mie Prefectural Museum
3060 Isshinden-kōzubeta
5140061 Tsu-shi
Mie
JP
論文著者
Ryoichi Tabata
Curator
Lake Biwa Museum
1091 Oroshimocho
5250001 Kusatsu
Shiga
JP
地理的範囲

Inland water habitats of Japan.

座標（緯度経度） 南 西 [23, 123], 北 東 [46, 150]
生物分類学的範囲

説明がありません

Kingdom  Animalia (Animals)
Phylum  Chordata (Chordates)
Subphylum  Craniata (Vertebrat es and hagfishes)
Class  Osteichthyes (Bony fishes and tetrapods)
Order  Cypriniformes (Carps, loaches, minnows and relatives)
Family  Botiidae (Botiid loach),  Cobitidae (True loaches),  Nemacheilidae (Stone loaches)
Species  Parabotia curtus ("Ayumodoki"),  Cobitis kaibarai ("Ariake-suji-shima-dojyô"),  Cobitis magnostriata ("Oogata-suji-shima-dojyô"),  Cobitis matsubarae ("Yamato-shima-dojyô"),  Cobitis sp. "yamato" complex Type A ("Yamato-shima-dojyô" (Type A)),  Cobitis sakahoko ("Oyodo-shima-dojyô"),  Cobitis shikokuensis ("Hina-ishi-dojyô"),  Cobitis sp. BIWAE type A ("Oo-shima-dojyô"),  Cobitis sp. BIWAE type B ("Nishi-shima-dojyô"),  Cobitis sp. BIWAE type C ("Higashi-shima-dojyô"),  Cobitis sp. BIWAE type D ("Tosas-shima-dojyô"),  Cobitis takatsuensis ("Ishi-dojyô"),  Cobitis takenoi ("Tango-suji-shima-dojyô"),  Misgurnus sp. (Clade A) ("Kita-dojyô"),  Misgurnus anguillicaudatus (Clade B1) ("Dojyô" (Japan clade)),  Misgurnus anguillicaudatus (Clade B2) ("Dojyô" (China clade)),  Misgurnus anguillicaudatus (jindai) ("Jindai-dojyô"),  Misgurnus sp. IR ("Shinobi-dojyô"),  Misgurnus sp. OK ("Hyoumon-dojyô"),  Misgurnus dabryanus ("Kara-dojyô"),  Niwaella delicata ("Ajime-dojyô"),  Barbatula oreas ("Fuku-dojyô"),  Lefua costata ("Hime-dojyô"),  Lefua echigonia ("Hotoke-dojyô"),  Lefua nikkonis ("Ezo-hotoke-dojyô"),  Lefua sp. 1 ("Nagare-hotoke-dojyô"),  Lefua sp. 2 ("Tôkai-nagare-hotoke-dojyô")
Subspecies  Cobitis minamorii minamorii ("San'yô-kogata-suji-shima-dojyô"),  Cobitis minamorii oumiensis ("Biwa-kogata-suji-shima-dojyô"),  Cobitis minamorii saninensis ("San'in-kogata-suji-shima-dojyô"),  Cobitis minamorii tokaiensis ("Tôkai-kogata-suji-shima-dojyô"),  Cobitis minamorii yodoensis ("Tôkai-kogata-suji-shima-dojyô"),  Cobitis striata fuchigamii ("Onga-suji-shima-dojyô"),  Cobitis striata hakataensis ("Hakata-suji-shima-dojyô"),  Cobitis striata striata ("Chûgata-suji-shima-dojyô")
時間的範囲
開始日 / 終了日 1954-06-06 / 2017-12-15
プロジェクトデータ

説明がありません

タイトル N/A
ファンデイング This work was partially supported by JSPS KAKENHI Grant Number 18HP8029.

プロジェクトに携わる要員:

論文著者
Yuichi Kano
収集方法

The specimens were generally captured by a hand-net in the fields.

Study Extent Specimens of loaches of Japan were collected from personal collections and museums.

Method step description:

  1. Photo images were taken in the fields by capturing individuals (Kano and Nakajima 2014) and/or by snorkeling. The formalin-fixed specimens were also photographed in the laboratory followed by CT scanning (Aloka Latheta LCT-200, Hitachi, Ltd.). 3D surface (CT value: -400 to -40) and skeletal (CT value: 5 to 200) models were extracted from the CT data. The CT data in raw file format was also stored and available on the web.
コレクションデータ
コレクション名 JNC/JNCP (J. Nakajima's personal collection)
コレクション名 KPM (Kanagawa Prefectural Museum of Natural History)
コレクション名 LBM (Lake Biwa Museum)
コレクション名 MPM/MPMQ (Mie Prefectural Museum)
コレクション名 OMNH (Osaka Museum of Natural History)
コレクション名 QUYK (Y. Kano's personal collection)
コレクション名 TKPM (Tokushima Prefectural Museum)
標本保存方法 Formalin
追加のメタデータ
代替識別子 1570db97-7b8d-4f12-9c3b-10c731460ca6
http://ipt.pensoft.net/resource?r=jp_loaches_3dct_models