Occurrence

Small-eared shrews (Mammalia, Cryptotis) in the Neotropical region

Последняя версия опубликована Biodiversity Data Journal 8 октября 2024 г. Biodiversity Data Journal
This database compiles comprehensive occurrence information based on voucher specimens of small-eared shrews, genus Cryptotis, that occur from México to Perú. The database collates curated data from four main sources: natural history museums, public databases, fieldwork, and literature. It contains 3,691 records from 53 species in eleven countries. Of the total, 86.5% have collecting dates, 46.6% of the specimens are sexed, and 74.5% have geo-referenced.
Дата публикации:
8 октября 2024 г.
Техническое обеспечение:
Biodiversity Data Journal
Лицензия:
CC-BY 4.0

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 3 639 записей.

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Загрузки

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 3 639 Записи в English (141 kB) - Частота обновления: ежегодно
Метаданные в формате EML Скачать в English (32 kB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (32 kB)

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Guevara L, Vargas-Cuenca J, Hortelano-Moncada Y, Cervantes F A (2024): Small-eared shrews (Mammalia, Cryptotis) in the Neotropical region. v1.2. Biodiversity Data Journal. Dataset/Occurrence. https://ipt.pensoft.net/resource?r=cryptotis&v=1.2

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Biodiversity Data Journal. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 004d2940-48cc-4d6f-9b49-59c6b5dac421.  Biodiversity Data Journal отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Participant Node Managers Committee.

Ключевые слова

Occurrence; Specimen

Контакты

Кто является создателем ресурса:

Lázaro Guevara
Julieta Vargas-Cuenca
Yolanda Hortelano-Moncada
Fernando A, Cervantes

Кто может ответить на вопросы о ресурсе:

Lázaro Guevara

Кем заполнены метаданные:

Lázaro Guevara

Кто еще связан с данным ресурсом:

Principal Investigator
Lázaro Guevara

Географический охват

Neotropical countries, from Mexico to Peru

Ограничивающие координаты Юг Запад [-5,7, -105,684], Север Восток [27,167, -67,083]

Таксономический охват

Описание отсутсвует

Kingdom  Animalia (Animals)
Phylum  Chordata (Chordates)
Subphylum  Vertebrata (Vertebrates)
Superclass  Therya (Therian mammals)
Class  Mammalia (Mammals)
Order  Eulipotyphla
Family  Soricidae (Shrews)
Tribe  Blarinini
Genus  Cryptotis (Small-eared shrews)

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 1891-01-01 / 2022-12-31

Данные проекта

This database compiles comprehensive occurrence information based on voucher specimens of small-eared shrews, genus Cryptotis, that occur from México to Peru. The database integrates the information obtained from four main sources: natural history museums, public databases, fieldwork, and scientific literature. It contains 3,639 records from 53 species in 12 countries. It aims to be a valuable resource for students, researchers, conservationists, and decision-makers.

Название A specimen-based database of small-eared shrews (Mammalia, Eulipotyphla, Cryptotis) in the Neotropical region
Финансирование This project has been funded by Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO, JM044), the National Science Foundation (DEB-2002202), Programa de Apoyo a Proyectos de Investigación e Innovación Tecnológica (PAPIIT, IA201521), and The City University of New York Research Award Program (PSC-CUNY 69647-00 47).
Описание района исследования The dataset contains records on 53 species of Cryptotis found in the territory from Mexico to Peru. The only species of the genus not included is Cryptotis parvus, which is of Nearctic affinity and distributed in the United States and Canada.
Описание плана выполнения исследований Shrews (Eulipotyphla, Soricidae) play an essential role in the structure and dynamics of populations of invertebrates, such as beetles, spiders, and earthworms, of which they feed voraciously. These small mammals are found in habitats throughout most of the planet but prefer humid tropical and temperate environments. Despite the high diversity and wide distribution of shrews, research on the natural history, taxonomy, systematics, distribution, and ecology is still surprisingly patchy. Recent large-scale reviews suggest that basic research on shrew species is urgently needed, particularly in tropical regions where they may be at serious risk of extinction due to combined pressures of land-use change and climate change. Small-eared shrews of the genus Cryptotis are the third most diverse among the 29 genera that comprise the entire family (Database 2024). In less than 20 years, the number of species in the genus has increased from 30 to 54. This number is expected to grow due to increased taxonomic work on the group, fieldwork, and the recent obtaining of genetic data. The genus is distributed from southern Canada to northern South America, with a remarkable species increase towards Central Mexico and Guatemala. In this region, the small-eared shrews have reached their greatest diversity and distribution, mainly restricted to mountain ecosystems characterized by cold and moist forests. The growing research activity around the genus in the Neotropics has caused taxonomic and nomenclatural changes and increased information on species' presence in previously unexplored regions and on poorly known taxa. Now, we have integrated a curated database of 3,678 voucher specimens of the 53 small-eared shrews found in this region by combining previously published records on digital databases, new data from fieldwork, scientific literature, and the revision of specimens in natural history museums.

Исполнители проекта:

Principal Investigator
Lázaro Guevara
Reviewer
Julieta Vargas-Cuenca
Reviewer
Yolanda Hortelano-Moncada
Curator
Fernando A. Cervantes

Методы сбора

Occurrence data were obtained from four primary sources (see Step description). For scientific collecting, we combined Sherman traps and pitfall traps. The localities were georeferenced in the field using global positioning systems. All scientific collecting was conducted under permits issued by the Mexican Government and prior authorization from the local authorities. We followed standard recommendations on specimen capture, sacrifice, and preparation of small mammals (Sikes et al., 2016).

Охват исследования Description: Neotropical countries, from Mexico to Peru. Coordinates: -5.7001 and 27.1672 Latitude; -105.6843 and to -67.0834 Longitude.
Контроль качества All original records were curated to confirm species identification and verify temporal and spatial congruence. We eliminated duplicates and records in which it was impossible to verify the specimen's catalog number. The final species list was checked using the Mammal Diversity Database (Version 1.7). Valid names were carefully reviewed and following the International Code of Zoological Nomenclature. The collection date was separated into day, month, and year. The locality for each record was also scrutinized to check its congruence with the distribution of the species according to the literature examined. The decimal degrees georeferenced of the records were verified or obtained using Google Earth Pro 7.3.6.9796. Ambiguous localities or locations with insufficient information were kept without assigned georeferenced.

Описание этапа методики:

  1. Step one: Data collection. Specimen records were obtained from four main sources: natural history museums, public online databases, literature, and fieldwork. a) Natural History Museums: We reviewed specimens in the following 21 scientific collections from Colombia, Ecuador, México, and the United States: Quito, Ecuador). Fluid bodies, skins, skulls, and/or postcranial skeletons were reviewed to corroborate or determine the taxonomic identity and obtain or verify the collecting data and sex of specimens. b) Public online databases: We consulted data in public databases of the following scientific collections that house specimens of shrews from the Neotropical region: American Museum of Natural History (AMNH); National Museum of Natural History, Smithsonian Institution (USNM), The University of Kansas, Natural History Museum (KU), British Museum of Natural History (BMNH); Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH-M). We also consulted the Arctos online collection management information system, the database related to the project “Modelado de la distribución potencial de las musarañas (Mammalia, Soricidae)” from the Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad, and the DataWebEcuador, a portal to access data of specimens from the collections of Ecuador. We also compare the information with what is available in Global Biodiversity Information Facility through a download on 8 April 2024 (https://doi.org/10.15468/dl.qtdnkn). c) Literature: We carefully reviewed the most recent literature to incorporate taxonomic and nomenclatural changes to the database. Additionally, we include new records that have not yet been digitized or are not still available in any database. d) Fieldwork: We carried out fieldwork aimed at the scientific collecting of shrews in nine states of Mexico: Chiapas, Colima, Estado de México, Hidalgo, Oaxaca, Puebla, San Luis Potosí, Tamaulipas, and Veracruz. Step two: Data integration. As mentioned in the Design Description sub-section, the taxonomy and nomenclature of small-eared shrews have changed intensively over the last two decades. Hence, the synonymy used by each researcher to identify the original work or identification was preserved. The taxonomic lists of the Mammal Diversity Database (Version 1.7) and Woodman (2019) were used as the base to unify the nomenclature. A combination of .csv and .dbf files was initially used to compile and curate the records. All data were migrated into a database following the Darwin Core Standard containing 36 column labels.

Данные коллекции

Название коллекции Instituto de Ciencias Biológicas de la Escuela Politécnica Nacional
Название коллекции Colección Mastozoológica, El Colegio de la Frontera Sur (ECO-SC-M; San Cristóbal de Las Casas, Chiapas)
Название коллекции The University of Kansas, Natural History Museum (KU; Lawrence, Kansas)
Название коллекции Museo de Zoología “Alfonso L. Herrera,” Facultad de Ciencias, UNAM (MZFC; México City, México)
Название коллекции Colección Zoológica Regional Mammalia, Instituto de Historia Natural y Ecología (CZRMA; Tuxtla Gutiérrez, Chiapas)
Название коллекции Museo de Zoología, Universidad de Ciencias y Artes de Chiapas (MZ-UNICACH; Tuxtla Gutiérrez, Chiapas)
Название коллекции Colección Mastozoológica, CIIDIR-IPN (OAX-MA; Oaxaca de Juárez, Oaxaca)
Название коллекции Colección de Mamíferos, CIByC, UAEM (CMC; Cuernavaca, Morelos)
Название коллекции Colección de Mamíferos, Universidad Autónoma Metropolitana Unidad Iztapalapa (UAMI; México City, México)
Название коллекции Colección de Mamíferos, Universidad Veracruzana (IIB-UV; Xalapa, Veracruz)
Название коллекции National Museum of Natural History, Smithsonian Institution (USNM; Washington, D.C.)
Название коллекции American Museum of Natural History (AMNH; New York, New York)
Название коллекции Colección Teriológica de la Universidad de Antioquia (CTUA; Medellín Colombia)
Название коллекции Instituto de Ciencias Naturales, Universidad Nacional (ICN; Bogotá, Colombia)
Название коллекции Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH, Villa de Leyva, Colombia)
Название коллекции Pontificia Universidad Javeriana (MPUJ; Bogotá, Colombia)
Название коллекции Museo de Historia Natural de la Universidad del Cauca (MHNUC, Popayán, Colombia)
Название коллекции Museo de La Salle (MLS, Bogotá, Colombia); Universidad del Valle (UV; Cali, Colombia)
Название коллекции Museo de Zoología de la Pontificia Universidad Católica del Ecuador (QCAZ; Quito, Ecuador)
Название коллекции Museo Ecuatoriano de Ciencias Naturales (MECN, Quito, Ecuador)
Название коллекции Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma de Nuevo León
Название коллекции Colección Nacional de Mamíferos, Instituto de Biología, Universidad Nacional Autónoma de México
Название коллекции Universidad de San Carlos de Guatemala
Название коллекции Secretaría de Medio Ambiente e Historia Natural
Название коллекции Escuela Nacional de Ciencias Biológicas, Instituto Politécnico Nacional
Название коллекции Museo de Biología de la Universidad del Zulia
Название коллекции El Colegio de la Frontera Sur, Unidad San Cristóbal de las Casas
Название коллекции Colección de Vertebrados de la Universidad de Los Andes
Название коллекции Instituto de Investigaciones Biológicas, Universidad Veracruzana
Название коллекции Museo de Biología de la Universidad Central de Venezuela
Название коллекции Centro de Investigación en Biodiversidad y Conservación, Universidad Autónoma del Estado de Morelos
Название коллекции Mammals housed at MHNG, Geneva
Название коллекции Abilene Christian University
Название коллекции Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Название коллекции Angelo State Natural History Collections
Название коллекции Instituto de Ciencias Naturales, Universidad Nacional de Colombia
Название коллекции Texas Cooperative Wildlife Collections, Texas A & M University
Название коллекции Natural History Museum UK
Название коллекции Colección Zoológica Regional Mammalia, Instituto de Historia Natural y Ecología
Название коллекции Museo de Ciencias Naturales de Guanare, Guanare
Название коллекции Museum of Natural Science, Louisiana State University
Название коллекции Museo de Historia Natural de la Universidad de Caldas
Название коллекции Museo de la Estación Biológica de Rancho Grande
Название коллекции Bell Museum of Natural History, University of Minnesota
Название коллекции Museo de Historia Natural de la Universidad Nacional San Agustín
Название коллекции Universidad del Valle, Valle del Cauca, Colombia
Название коллекции Estación Biológica de Doñana
Название коллекции Museo de Historia Natural, Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Название коллекции Field Museum of Natural History
Название коллекции Sternberg Museum of Natural History, Fort Hays State University
Название коллекции Natural History Museum, Los Angeles County
Название коллекции Cornell University Museum of Vertebrates
Название коллекции University of California, Los Angeles
Название коллекции Museo de Historia Natural La Salle
Название коллекции California Academy of Sciences
Название коллекции Biodiversity Institute and Natural History Museum, University of Kansas
Название коллекции Academy of Natural Sciences of Drexel University
Название коллекции Senckenberg Forschungsinstitut und Naturmuseum Frankfurt
Название коллекции Texas Tech University
Название коллекции Sam Noble Oklahoma Museum of Natural History, University of Oklahoma
Название коллекции Museum of Comparative Zoology, Harvard University
Название коллекции Brigham Young University Life Science Museum
Название коллекции University of Wisconsin Zoological Museum
Название коллекции Florida Museum of Natural History, University of Florida
Название коллекции Museum of Southwestern Biology
Название коллекции American Museum of Natural History
Название коллекции University of Iowa Museum of Natural History
Название коллекции Royal Ontario Museum
Название коллекции University of Michigan, Museum of Zoology
Название коллекции Museum of Vertebrate Zoology, University of California, Berkeley
Название коллекции Carnegie Museum of Natural History
Название коллекции University of California, Davis
Название коллекции Hungarian Natural History Museum
Название коллекции Chicago Academy of Sciences
Название коллекции Corporación Autónoma Regional del Centro de Antioquia
Название коллекции Museo Nacional de Costa Rica
Название коллекции Universidad Central Del Ecuador
Название коллекции The University of Arizona, Museum of Natural History
Название коллекции Yale Peabody Museum of Natural History, Yale University

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы 004d2940-48cc-4d6f-9b49-59c6b5dac421
https://ipt.pensoft.net/resource?r=cryptotis