This database compiles comprehensive occurrence information based on voucher specimens of small-eared shrews, genus Cryptotis, that occur from México to Perú. The database collates curated data from four main sources: natural history museums, public databases, fieldwork, and literature. It contains 3,691 records from 53 species in eleven countries. Of the total, 86.5% have collecting dates, 46.6% of the specimens are sexed, and 74.5% have geo-referenced.
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Guevara L, Vargas-Cuenca J, Hortelano-Moncada Y, Cervantes F A (2025). Small-eared shrews (Mammalia, Cryptotis) in the Neotropical region. Version 1.3. Biodiversity Data Journal. Occurrence dataset. https://ipt.pensoft.net/resource?r=cryptotis&v=1.3
Neotropical countries, from Mexico to Peru
| Coordenadas límite |
Latitud Mínima Longitud Mínima [-5,7, -105,684], Latitud Máxima Longitud Máxima [27,167, -67,083] |
No hay descripción disponible
| Reino |
Animalia (Animals)
|
| Filo |
Chordata (Chordates)
|
| Subfilo |
Vertebrata (Vertebrates)
|
| Superclase |
Therya (Therian mammals)
|
| Class |
Mammalia (Mammals)
|
| Orden |
Eulipotyphla
|
| Familia |
Soricidae (Shrews)
|
| Tribu |
Blarinini
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| Género |
Cryptotis (Small-eared shrews)
|
| Fecha Inicial / Fecha Final |
1891-01-01 / 2022-12-31 |
This database compiles comprehensive occurrence information based on voucher specimens of small-eared shrews, genus Cryptotis, that occur from México to Peru. The database integrates the information obtained from four main sources: natural history museums, public databases, fieldwork, and scientific literature. It contains 3,639 records from 53 species in 12 countries. It aims to be a valuable resource for students, researchers, conservationists, and decision-makers.
| Título |
A specimen-based database of small-eared shrews (Mammalia, Eulipotyphla, Cryptotis) in the Neotropical region |
| Fuentes de Financiación |
This project has been funded by Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO, JM044), the National Science
Foundation (DEB-2002202), Programa de Apoyo a Proyectos de Investigación e Innovación Tecnológica (PAPIIT, IA201521), and The City University of New York
Research Award Program (PSC-CUNY 69647-00 47). |
| Descripción del área de estudio |
The dataset contains records on 53 species of Cryptotis found in the territory from Mexico to Peru. The only species of the genus not included is Cryptotis parvus, which is of Nearctic affinity and distributed in the United States and Canada. |
| Descripción del diseño |
Shrews (Eulipotyphla, Soricidae) play an essential role in the structure and dynamics of populations of invertebrates, such as beetles, spiders, and earthworms, of which they feed voraciously. These small mammals are found in habitats throughout most of the planet but prefer humid tropical and temperate environments. Despite the high diversity and wide distribution of shrews, research on the natural history, taxonomy, systematics, distribution, and ecology is still surprisingly patchy. Recent large-scale reviews suggest that basic research on shrew species is urgently needed, particularly in tropical regions where they may be at serious risk of extinction due to combined pressures of land-use change and climate change.
Small-eared shrews of the genus Cryptotis are the third most diverse among the 29 genera that comprise the entire family (Database 2024). In less than 20 years, the number of species in the genus has increased from 30 to 54. This number is expected to grow due to increased taxonomic work on the group, fieldwork, and the recent obtaining of genetic data. The genus is distributed from southern Canada to northern South America, with a remarkable species increase towards Central Mexico and Guatemala. In this region, the small-eared shrews have reached their greatest diversity and distribution, mainly restricted to mountain ecosystems characterized by cold and moist forests. The growing research activity around the genus in the Neotropics has caused taxonomic and nomenclatural changes and increased information on species' presence in previously unexplored regions and on poorly known taxa. Now, we have integrated a curated database of 3,678 voucher specimens of the 53 small-eared shrews found in this region by combining previously published records on digital databases, new data from fieldwork, scientific literature, and the revision of specimens in natural history museums. |
Personas asociadas al proyecto:
Occurrence data were obtained from four primary sources (see Step description). For scientific collecting, we combined Sherman traps and pitfall traps. The localities were georeferenced in the field using global positioning systems. All scientific collecting was conducted under permits issued by the Mexican Government and prior authorization from the local authorities. We followed standard recommendations on specimen capture, sacrifice, and preparation of small mammals (Sikes et al., 2016).
| Área de Estudio |
Description: Neotropical countries, from Mexico to Peru. Coordinates: -5.7001 and 27.1672 Latitude; -105.6843 and to -67.0834 Longitude. |
| Control de Calidad |
All original records were curated to confirm species identification and verify temporal and spatial congruence. We eliminated duplicates and records in which it was impossible to verify the specimen's catalog number. The final species list was checked using the Mammal Diversity Database (Version 1.7). Valid names were carefully reviewed and following the International Code of Zoological Nomenclature. The collection date was separated into day, month, and year. The locality for each record was also scrutinized to check its congruence with the distribution of the species according to the literature examined. The decimal degrees georeferenced of the records were verified or obtained using Google Earth Pro 7.3.6.9796. Ambiguous localities or locations with insufficient information were kept without assigned georeferenced. |
Descripción de la metodología paso a paso:
-
Step one: Data collection.
Specimen records were obtained from four main sources: natural history museums, public online databases, literature, and fieldwork.
a) Natural History Museums: We reviewed specimens in the following 21 scientific collections from Colombia, Ecuador, México, and the United States: Quito, Ecuador). Fluid bodies, skins, skulls, and/or postcranial skeletons were reviewed to corroborate or determine the taxonomic identity and obtain or verify the collecting data and sex of specimens.
b) Public online databases: We consulted data in public databases of the following scientific collections that house specimens of shrews from the Neotropical region: American Museum of Natural History (AMNH); National Museum of Natural History, Smithsonian Institution (USNM), The University of Kansas, Natural History Museum (KU), British Museum of Natural History (BMNH); Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH-M). We also consulted the Arctos online collection management information system, the database related to the project “Modelado de la distribución potencial de las musarañas (Mammalia, Soricidae)” from the Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad, and the DataWebEcuador, a portal to access data of specimens from the collections of Ecuador. We also compare the information with what is available in Global Biodiversity Information Facility through a download on 8 April 2024 (https://doi.org/10.15468/dl.qtdnkn).
c) Literature: We carefully reviewed the most recent literature to incorporate taxonomic and nomenclatural changes to the database. Additionally, we include new records that have not yet been digitized or are not still available in any database.
d) Fieldwork: We carried out fieldwork aimed at the scientific collecting of shrews in nine states of Mexico: Chiapas, Colima, Estado de México, Hidalgo, Oaxaca,
Puebla, San Luis Potosí, Tamaulipas, and Veracruz.
Step two: Data integration.
As mentioned in the Design Description sub-section, the taxonomy and nomenclature of small-eared shrews have changed intensively over the last two decades. Hence, the synonymy used by each researcher to identify the original work or identification was preserved. The taxonomic lists of the Mammal Diversity Database (Version 1.7) and Woodman (2019) were used as the base to unify the nomenclature. A combination of .csv and .dbf files was initially used to compile and curate the records. All data were migrated into a database following the Darwin Core Standard containing 36 column labels.
| Nombre de la Colección |
Instituto de Ciencias Biológicas de la Escuela Politécnica Nacional |
| Nombre de la Colección |
Colección Mastozoológica, El Colegio de la Frontera Sur (ECO-SC-M; San Cristóbal de Las Casas, Chiapas) |
| Nombre de la Colección |
The University of Kansas, Natural History Museum (KU; Lawrence, Kansas) |
| Nombre de la Colección |
Museo de Zoología “Alfonso L. Herrera,” Facultad de Ciencias, UNAM (MZFC; México City, México) |
| Nombre de la Colección |
Colección Zoológica Regional Mammalia, Instituto de Historia Natural y Ecología (CZRMA; Tuxtla Gutiérrez, Chiapas) |
| Nombre de la Colección |
Museo de Zoología, Universidad de Ciencias y Artes de Chiapas (MZ-UNICACH; Tuxtla Gutiérrez, Chiapas) |
| Nombre de la Colección |
Colección Mastozoológica, CIIDIR-IPN (OAX-MA; Oaxaca de Juárez, Oaxaca) |
| Nombre de la Colección |
Colección de Mamíferos, CIByC, UAEM (CMC; Cuernavaca, Morelos) |
| Nombre de la Colección |
Colección de Mamíferos, Universidad Autónoma Metropolitana Unidad Iztapalapa (UAMI; México City, México) |
| Nombre de la Colección |
Colección de Mamíferos, Universidad Veracruzana (IIB-UV; Xalapa, Veracruz) |
| Nombre de la Colección |
National Museum of Natural History, Smithsonian Institution (USNM; Washington, D.C.) |
| Nombre de la Colección |
American Museum of Natural History (AMNH; New York, New York) |
| Nombre de la Colección |
Colección Teriológica de la Universidad de Antioquia (CTUA; Medellín Colombia) |
| Nombre de la Colección |
Instituto de Ciencias Naturales, Universidad Nacional (ICN; Bogotá, Colombia) |
| Nombre de la Colección |
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH, Villa de Leyva, Colombia) |
| Nombre de la Colección |
Pontificia Universidad Javeriana (MPUJ; Bogotá, Colombia) |
| Nombre de la Colección |
Museo de Historia Natural de la Universidad del Cauca (MHNUC, Popayán, Colombia) |
| Nombre de la Colección |
Museo de La Salle (MLS, Bogotá, Colombia); Universidad del Valle (UV; Cali, Colombia) |
| Nombre de la Colección |
Museo de Zoología de la Pontificia Universidad Católica del Ecuador (QCAZ; Quito, Ecuador) |
| Nombre de la Colección |
Museo Ecuatoriano de Ciencias Naturales (MECN, Quito, Ecuador) |
| Nombre de la Colección |
Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma de Nuevo León |
| Nombre de la Colección |
Colección Nacional de Mamíferos, Instituto de Biología, Universidad Nacional Autónoma de México |
| Nombre de la Colección |
Universidad de San Carlos de Guatemala |
| Nombre de la Colección |
Secretaría de Medio Ambiente e Historia Natural |
| Nombre de la Colección |
Escuela Nacional de Ciencias Biológicas, Instituto Politécnico Nacional |
| Nombre de la Colección |
Museo de Biología de la Universidad del Zulia |
| Nombre de la Colección |
El Colegio de la Frontera Sur, Unidad San Cristóbal de las Casas |
| Nombre de la Colección |
Colección de Vertebrados de la Universidad de Los Andes |
| Nombre de la Colección |
Instituto de Investigaciones Biológicas, Universidad Veracruzana |
| Nombre de la Colección |
Museo de Biología de la Universidad Central de Venezuela |
| Nombre de la Colección |
Centro de Investigación en Biodiversidad y Conservación, Universidad Autónoma del Estado de Morelos |
| Nombre de la Colección |
Mammals housed at MHNG, Geneva |
| Nombre de la Colección |
Abilene Christian University |
| Nombre de la Colección |
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt |
| Nombre de la Colección |
Angelo State Natural History Collections |
| Nombre de la Colección |
Instituto de Ciencias Naturales, Universidad Nacional de Colombia |
| Nombre de la Colección |
Texas Cooperative Wildlife Collections, Texas A & M University |
| Nombre de la Colección |
Natural History Museum UK |
| Nombre de la Colección |
Colección Zoológica Regional Mammalia, Instituto de Historia Natural y Ecología |
| Nombre de la Colección |
Museo de Ciencias Naturales de Guanare, Guanare |
| Nombre de la Colección |
Museum of Natural Science, Louisiana State University |
| Nombre de la Colección |
Museo de Historia Natural de la Universidad de Caldas |
| Nombre de la Colección |
Museo de la Estación Biológica de Rancho Grande |
| Nombre de la Colección |
Bell Museum of Natural History, University of Minnesota |
| Nombre de la Colección |
Museo de Historia Natural de la Universidad Nacional San Agustín |
| Nombre de la Colección |
Universidad del Valle, Valle del Cauca, Colombia |
| Nombre de la Colección |
Estación Biológica de Doñana |
| Nombre de la Colección |
Museo de Historia Natural, Universidad Nacional Mayor de San Marcos |
| Nombre de la Colección |
Field Museum of Natural History |
| Nombre de la Colección |
Sternberg Museum of Natural History, Fort Hays State University |
| Nombre de la Colección |
Natural History Museum, Los Angeles County |
| Nombre de la Colección |
Cornell University Museum of Vertebrates |
| Nombre de la Colección |
University of California, Los Angeles |
| Nombre de la Colección |
Museo de Historia Natural La Salle |
| Nombre de la Colección |
California Academy of Sciences |
| Nombre de la Colección |
Biodiversity Institute and Natural History Museum, University of Kansas |
| Nombre de la Colección |
Academy of Natural Sciences of Drexel University |
| Nombre de la Colección |
Senckenberg Forschungsinstitut und Naturmuseum Frankfurt |
| Nombre de la Colección |
Texas Tech University |
| Nombre de la Colección |
Sam Noble Oklahoma Museum of Natural History, University of Oklahoma |
| Nombre de la Colección |
Museum of Comparative Zoology, Harvard University |
| Nombre de la Colección |
Brigham Young University Life Science Museum |
| Nombre de la Colección |
University of Wisconsin Zoological Museum |
| Nombre de la Colección |
Florida Museum of Natural History, University of Florida |
| Nombre de la Colección |
Museum of Southwestern Biology |
| Nombre de la Colección |
American Museum of Natural History |
| Nombre de la Colección |
University of Iowa Museum of Natural History |
| Nombre de la Colección |
Royal Ontario Museum |
| Nombre de la Colección |
University of Michigan, Museum of Zoology |
| Nombre de la Colección |
Museum of Vertebrate Zoology, University of California, Berkeley |
| Nombre de la Colección |
Carnegie Museum of Natural History |
| Nombre de la Colección |
University of California, Davis |
| Nombre de la Colección |
Hungarian Natural History Museum |
| Nombre de la Colección |
Chicago Academy of Sciences |
| Nombre de la Colección |
Corporación Autónoma Regional del Centro de Antioquia |
| Nombre de la Colección |
Museo Nacional de Costa Rica |
| Nombre de la Colección |
Universidad Central Del Ecuador |
| Nombre de la Colección |
The University of Arizona, Museum of Natural History |
| Nombre de la Colección |
Yale Peabody Museum of Natural History, Yale University |
http://orcid.org/https://orcid.org/0000-0002-5485-7056