croplm
Última versión Publicado por Biodiversity Data Journal en 13 de febrero de 2024 Biodiversity Data Journal

Stoneflies of Medvednica Nature Park: genetic diversity and morphological variability

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Registros

Los datos en este registros biológicos recurso han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 25 registros.

Este IPT archiva los datos, sirviendo así como repositorio de datos. Los datos y metadatos están disponibles para descargar en la sección de descargas. La tabla de versiones muestra otras versiones del recurso que se han hecho accesibles al público y permite el seguimiento de los cambios hechos al recurso en el tiempo.

Descargas

Descargue la última versión de los datos como un Archivo Darwin Core (DwC-A) o los metadatos como EML o RTF:

Datos como un archivo DwC-A descargar 25 registros en Inglés (6 kB) - Frecuencia de actualización: desconocido
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Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Kermek D, Pischiutta N, Hlebec D (2024): croplm. v1.2. Biodiversity Data Journal. Dataset/Occurrence. https://ipt.pensoft.net/resource?r=croplm&v=1.2

Derechos

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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Biodiversity Data Journal. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: f5b16e64-610a-4fcf-b46d-3efb068caaa1.  Biodiversity Data Journal publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Participant Node Managers Committee.

Palabras Clave

Occurrence; Specimen; stoneflies; Medvednica Mt.; Croatia; biodiversity

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

Dora Kermek
Student
Faculty of Science, University of Zagreb
HR
Nikola Pischiutta
Student
Faculty of Science, University of Zagreb
Dora Hlebec
Assistant
Faculty of Science, University of Zagreb

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

Dora Hlebec
Assistant
Faculty of Science, University of Zagreb
Horvatovac 102a
10000 Zagreb
HR

¿Quién documentó los metadatos?:

Dora Hlebec
Assistant
Faculty of Science, University of Zagreb
Horvatovac 102a
10000 Zagreb
HR

¿Quién más está asociado con el recurso?:

Curador
Iva Mihoci
Curator
Croatian Natural History Museum
Demetrova 1
10000 Zagreb
HR
Cobertura Geográfica

Croatia (Medvednica Mt.)

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-90, -180], Latitud Máxima Longitud Máxima [90, 180]
Cobertura Taxonómica

Stoneflies

Orden  Plecoptera (Stoneflies)
Cobertura Temporal
Fecha Inicial / Fecha Final 2021-06-17 / 2022-03-04
Datos del Proyecto

Medvednica Nature Park, located near Croatia's capital and largest city, Zagreb, experiences significant urbanization, which strongly impacts the fauna within this ecosystem. Surprisingly, despite the area's diverse (micro)habitats, including the discovery of several rare species previously unknown in the Croatian fauna, comprehensive field research on any group of organisms, coupled with an integrative approach, has never been conducted in this region. In this study, we present the first insights into the genetic and morphological diversity of stoneflies, one of the most endangered groups of organisms overall. Phylogenetic reconstructions and species delineation methods revealed significant intraspecific haplotype variation in most examined species (e.g., Brachyptera seticornis, Isoperla grammatica, and Leuctra braueri), except for Leuctra prima. Additionally, our study has identified isolated populations that merit further in-depth investigation concerning morphology, genetics, and ecology. These findings contribute valuable knowledge to the conservation of stoneflies in this area.

Título Utilizing public sequence databases to identify genetic diversity of stoneflies in Medvednica Nature Park
Identificador Dora Kermek, Nikola Pischiutta
Fuentes de Financiación Croatian Science Foundation
Descripción del Área de Estudio Medvednica Mt., Croatia
Descripción del Diseño Project provides the first insight into the genetic and morphological diversity of stoneflies in the Medvednica Nature Park, thereby contributing to the faunal knowledge of the area. Additionally, it establishes phylogenetic and phylogeographical relationships between populations of widely distributed species in Europe: Brachyptera seticornis, Isoperla grammatica, Leuctra braueri, and Leuctra prima. These relationships enhance understanding of diversification patterns and the biogeographic history of these selected stonefly species, emphasizing populations that warrant further detailed morphological, genetic, and ecological investigation.

Personas asociadas al proyecto:

Métodos de Muestreo

Adults were collected using an entomological net while larvae were collected by hand under stones and branches.

Área de Estudio Specimens were collected at eight sampling sites in Medvednica Nature Park.
Control de Calidad All collected individuals were preserved in ethanol. Morphological determination of adults was conducted using a ZEISS SteREO Discovery V20 stereo microscope along with various identification keys. Due to the lack of identification keys the larvae were not determined to the species level. Larval identification was carried out by comparing their sequences with sequences available in databases.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. Total genomic DNA was isolated from the tissues of one to three legs of adults and larvae using the GenElute Mammalian Genomic DNA Miniprep Kit. Chromatograms were analyzed and edited in Geneious Prime. Misread nucleotides were manually corrected. The presence of stop codons in all sequences was checked using Mesquite. Poor quality sequences and those containing stop codons were excluded from further analyses. For phylogeographic analyses, we selected species with a broader distribution and a larger number of COI sequences available in the BOLD and GenBank databases.
Datos de la Colección
Nombre de la Colección Collection Plecoptera Sivec&Hlebec
Métodos de preservación de los ejemplares Alcohol
Unidades Curatoriales Entre 488 y 512 vial
Metadatos Adicionales
Identificadores Alternativos https://ipt.pensoft.net/resource?r=croplm