croplm
最新バージョン Biodiversity Data Journal によって公開 2024/02/13 Biodiversity Data Journal

Stoneflies of Medvednica Nature Park: genetic diversity and morphological variability

GBIF DwC A EML RTF バージョン 権利 これを引用してください。
データ レコード

この オカレンス(観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、25 レコードが含まれています。

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

ダウンロード

DwC-A形式のリソース データまたは EML / RTF 形式のリソース メタデータの最新バージョンをダウンロード:

DwC ファイルとしてのデータ ダウンロード 25 レコード English で (6 kB) - 更新頻度: unknown
EML ファイルとしてのメタデータ ダウンロード English で (11 kB)
RTF ファイルとしてのメタデータ ダウンロード English で (10 kB)
バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Kermek D, Pischiutta N, Hlebec D (2024): croplm. v1.2. Biodiversity Data Journal. Dataset/Occurrence. https://ipt.pensoft.net/resource?r=croplm&v=1.2

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Biodiversity Data Journal。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: f5b16e64-610a-4fcf-b46d-3efb068caaa1が割り当てられています。   Participant Node Managers Committee によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているBiodiversity Data Journal が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Occurrence; Specimen; stoneflies; Medvednica Mt.; Croatia; biodiversity

連絡先

リソースを作成した人:

Dora Kermek
Student
Faculty of Science, University of Zagreb
HR
Nikola Pischiutta
Student
Faculty of Science, University of Zagreb
Dora Hlebec
Assistant
Faculty of Science, University of Zagreb

リソースに関する質問に答えることができる人:

Dora Hlebec
Assistant
Faculty of Science, University of Zagreb
Horvatovac 102a
10000 Zagreb
HR

メタデータを記載した人:

Dora Hlebec
Assistant
Faculty of Science, University of Zagreb
Horvatovac 102a
10000 Zagreb
HR

他に、リソースに関連付けられていた人:

キュレーター
Iva Mihoci
Curator
Croatian Natural History Museum
Demetrova 1
10000 Zagreb
HR
地理的範囲

Croatia (Medvednica Mt.)

座標(緯度経度) 南 西 [-90, -180], 北 東 [90, 180]
生物分類学的範囲

Stoneflies

Order  Plecoptera (Stoneflies)
時間的範囲
開始日 / 終了日 2021-06-17 / 2022-03-04
プロジェクトデータ

Medvednica Nature Park, located near Croatia's capital and largest city, Zagreb, experiences significant urbanization, which strongly impacts the fauna within this ecosystem. Surprisingly, despite the area's diverse (micro)habitats, including the discovery of several rare species previously unknown in the Croatian fauna, comprehensive field research on any group of organisms, coupled with an integrative approach, has never been conducted in this region. In this study, we present the first insights into the genetic and morphological diversity of stoneflies, one of the most endangered groups of organisms overall. Phylogenetic reconstructions and species delineation methods revealed significant intraspecific haplotype variation in most examined species (e.g., Brachyptera seticornis, Isoperla grammatica, and Leuctra braueri), except for Leuctra prima. Additionally, our study has identified isolated populations that merit further in-depth investigation concerning morphology, genetics, and ecology. These findings contribute valuable knowledge to the conservation of stoneflies in this area.

タイトル Utilizing public sequence databases to identify genetic diversity of stoneflies in Medvednica Nature Park
識別子 Dora Kermek, Nikola Pischiutta
ファンデイング Croatian Science Foundation
Study Area Description Medvednica Mt., Croatia
研究の意図、目的、背景など(デザイン) Project provides the first insight into the genetic and morphological diversity of stoneflies in the Medvednica Nature Park, thereby contributing to the faunal knowledge of the area. Additionally, it establishes phylogenetic and phylogeographical relationships between populations of widely distributed species in Europe: Brachyptera seticornis, Isoperla grammatica, Leuctra braueri, and Leuctra prima. These relationships enhance understanding of diversification patterns and the biogeographic history of these selected stonefly species, emphasizing populations that warrant further detailed morphological, genetic, and ecological investigation.

プロジェクトに携わる要員:

論文著者
Dora Hlebec
収集方法

Adults were collected using an entomological net while larvae were collected by hand under stones and branches.

Study Extent Specimens were collected at eight sampling sites in Medvednica Nature Park.
Quality Control All collected individuals were preserved in ethanol. Morphological determination of adults was conducted using a ZEISS SteREO Discovery V20 stereo microscope along with various identification keys. Due to the lack of identification keys the larvae were not determined to the species level. Larval identification was carried out by comparing their sequences with sequences available in databases.

Method step description:

  1. Total genomic DNA was isolated from the tissues of one to three legs of adults and larvae using the GenElute Mammalian Genomic DNA Miniprep Kit. Chromatograms were analyzed and edited in Geneious Prime. Misread nucleotides were manually corrected. The presence of stop codons in all sequences was checked using Mesquite. Poor quality sequences and those containing stop codons were excluded from further analyses. For phylogeographic analyses, we selected species with a broader distribution and a larger number of COI sequences available in the BOLD and GenBank databases.
コレクションデータ
コレクション名 Collection Plecoptera Sivec&Hlebec
標本保存方法 Alcohol
Curatorialユニット 範囲 488 ~ 512 vial
追加のメタデータ