croplm
Stoneflies of Medvednica Nature Park: genetic diversity and morphological variability
Enregistrements de données
Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 25 enregistrements.
Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées des ressources sont disponibles au téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.
Téléchargements
Téléchargez la dernière version de la ressource en tant qu'Archive Darwin Core (DwC-A), ou les métadonnées de la ressource au format EML ou RTF :
Données sous forme de fichier DwC-A (zip) | télécharger 25 enregistrements dans Anglais (6 kB) - Fréquence de mise à jour: inconnue |
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Métadonnées sous forme de fichier RTF | télécharger dans Anglais (10 kB) |
Versions
Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.
Comment citer
Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:
Kermek D, Pischiutta N, Hlebec D (2024): croplm. v1.2. Biodiversity Data Journal. Dataset/Occurrence. https://ipt.pensoft.net/resource?r=croplm&v=1.2
Droits
Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:
L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Biodiversity Data Journal. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.
Enregistrement GBIF
Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : f5b16e64-610a-4fcf-b46d-3efb068caaa1. Biodiversity Data Journal publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Participant Node Managers Committee.
Mots-clé
Occurrence; Specimen; stoneflies; Medvednica Mt.; Croatia; biodiversity
Contacts
Personne ayant créé cette ressource:
Personne pouvant répondre aux questions sur la ressource:
Personne ayant renseigné les métadonnées:
Autres personnes associées à la ressource:
Couverture géographique
Croatia (Medvednica Mt.)
Enveloppe géographique | Sud Ouest [-90, -180], Nord Est [90, 180] |
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Couverture taxonomique
Stoneflies
Order | Plecoptera (Stoneflies) |
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Couverture temporelle
Date de début / Date de fin | 2021-06-17 / 2022-03-04 |
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Données sur le projet
Medvednica Nature Park, located near Croatia's capital and largest city, Zagreb, experiences significant urbanization, which strongly impacts the fauna within this ecosystem. Surprisingly, despite the area's diverse (micro)habitats, including the discovery of several rare species previously unknown in the Croatian fauna, comprehensive field research on any group of organisms, coupled with an integrative approach, has never been conducted in this region. In this study, we present the first insights into the genetic and morphological diversity of stoneflies, one of the most endangered groups of organisms overall. Phylogenetic reconstructions and species delineation methods revealed significant intraspecific haplotype variation in most examined species (e.g., Brachyptera seticornis, Isoperla grammatica, and Leuctra braueri), except for Leuctra prima. Additionally, our study has identified isolated populations that merit further in-depth investigation concerning morphology, genetics, and ecology. These findings contribute valuable knowledge to the conservation of stoneflies in this area.
Titre | Utilizing public sequence databases to identify genetic diversity of stoneflies in Medvednica Nature Park |
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Identifiant | Dora Kermek, Nikola Pischiutta |
Financement | Croatian Science Foundation |
Description du domaine d'étude / de recherche | Medvednica Mt., Croatia |
Description du design | Project provides the first insight into the genetic and morphological diversity of stoneflies in the Medvednica Nature Park, thereby contributing to the faunal knowledge of the area. Additionally, it establishes phylogenetic and phylogeographical relationships between populations of widely distributed species in Europe: Brachyptera seticornis, Isoperla grammatica, Leuctra braueri, and Leuctra prima. These relationships enhance understanding of diversification patterns and the biogeographic history of these selected stonefly species, emphasizing populations that warrant further detailed morphological, genetic, and ecological investigation. |
Les personnes impliquées dans le projet:
Méthodes d'échantillonnage
Adults were collected using an entomological net while larvae were collected by hand under stones and branches.
Etendue de l'étude | Specimens were collected at eight sampling sites in Medvednica Nature Park. |
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Contrôle qualité | All collected individuals were preserved in ethanol. Morphological determination of adults was conducted using a ZEISS SteREO Discovery V20 stereo microscope along with various identification keys. Due to the lack of identification keys the larvae were not determined to the species level. Larval identification was carried out by comparing their sequences with sequences available in databases. |
Description des étapes de la méthode:
- Total genomic DNA was isolated from the tissues of one to three legs of adults and larvae using the GenElute Mammalian Genomic DNA Miniprep Kit. Chromatograms were analyzed and edited in Geneious Prime. Misread nucleotides were manually corrected. The presence of stop codons in all sequences was checked using Mesquite. Poor quality sequences and those containing stop codons were excluded from further analyses. For phylogeographic analyses, we selected species with a broader distribution and a larger number of COI sequences available in the BOLD and GenBank databases.
Données de collection
Nom de la collection | Collection Plecoptera Sivec&Hlebec |
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Méthode de conservation des spécimens | Alcohol |
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Unités de conservation | Entre (nombre minimal) 488 et (nombre maximal) 512 vial |
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Métadonnées additionnelles
Identifiants alternatifs | https://ipt.pensoft.net/resource?r=croplm |
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