croplm
Последняя версия опубликована Biodiversity Data Journal 13 февраля 2024 г. Biodiversity Data Journal

Stoneflies of Medvednica Nature Park: genetic diversity and morphological variability

GBIF DwC-A EML RTF Версии Права Процитируйте это
Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 25 записей.

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем (репозиторием) данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. Перечень версий служит для отображения истории публикации версий данного ресурса.

Загрузки

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 25 Записи в English (6 kB) - Частота обновления: unknown
Метаданные в формате EML Скачать в English (11 kB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (10 kB)
Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Kermek D, Pischiutta N, Hlebec D (2024): croplm. v1.2. Biodiversity Data Journal. Dataset/Occurrence. https://ipt.pensoft.net/resource?r=croplm&v=1.2

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Biodiversity Data Journal. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: f5b16e64-610a-4fcf-b46d-3efb068caaa1.  Biodiversity Data Journal отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Participant Node Managers Committee.

Ключевые слова

Occurrence; Specimen; stoneflies; Medvednica Mt.; Croatia; biodiversity

Контакты

Кто является создателем ресурса:

Dora Kermek
Student
Faculty of Science, University of Zagreb
HR
Nikola Pischiutta
Student
Faculty of Science, University of Zagreb
Dora Hlebec
Assistant
Faculty of Science, University of Zagreb

Кто может ответить на вопросы о ресурсе:

Dora Hlebec
Assistant
Faculty of Science, University of Zagreb
Horvatovac 102a
10000 Zagreb
HR

Кем заполнены метаданные:

Dora Hlebec
Assistant
Faculty of Science, University of Zagreb
Horvatovac 102a
10000 Zagreb
HR

Кто еще связан с данным ресурсом:

Curator
Iva Mihoci
Curator
Croatian Natural History Museum
Demetrova 1
10000 Zagreb
HR
Географический охват

Croatia (Medvednica Mt.)

Ограничивающие координаты Юг Запад [-90, -180], Север Восток [90, 180]
Таксономический охват

Stoneflies

Order  Plecoptera (Stoneflies)
Временной охват
Дата начала / Дата окончания 2021-06-17 / 2022-03-04
Данные проекта

Medvednica Nature Park, located near Croatia's capital and largest city, Zagreb, experiences significant urbanization, which strongly impacts the fauna within this ecosystem. Surprisingly, despite the area's diverse (micro)habitats, including the discovery of several rare species previously unknown in the Croatian fauna, comprehensive field research on any group of organisms, coupled with an integrative approach, has never been conducted in this region. In this study, we present the first insights into the genetic and morphological diversity of stoneflies, one of the most endangered groups of organisms overall. Phylogenetic reconstructions and species delineation methods revealed significant intraspecific haplotype variation in most examined species (e.g., Brachyptera seticornis, Isoperla grammatica, and Leuctra braueri), except for Leuctra prima. Additionally, our study has identified isolated populations that merit further in-depth investigation concerning morphology, genetics, and ecology. These findings contribute valuable knowledge to the conservation of stoneflies in this area.

Название Utilizing public sequence databases to identify genetic diversity of stoneflies in Medvednica Nature Park
Идентификатор Dora Kermek, Nikola Pischiutta
Финансирование Croatian Science Foundation
Описание района исследования Medvednica Mt., Croatia
Описание плана выполнения исследований Project provides the first insight into the genetic and morphological diversity of stoneflies in the Medvednica Nature Park, thereby contributing to the faunal knowledge of the area. Additionally, it establishes phylogenetic and phylogeographical relationships between populations of widely distributed species in Europe: Brachyptera seticornis, Isoperla grammatica, Leuctra braueri, and Leuctra prima. These relationships enhance understanding of diversification patterns and the biogeographic history of these selected stonefly species, emphasizing populations that warrant further detailed morphological, genetic, and ecological investigation.

Исполнители проекта:

Методы сбора

Adults were collected using an entomological net while larvae were collected by hand under stones and branches.

Охват исследования Specimens were collected at eight sampling sites in Medvednica Nature Park.
Контроль качества All collected individuals were preserved in ethanol. Morphological determination of adults was conducted using a ZEISS SteREO Discovery V20 stereo microscope along with various identification keys. Due to the lack of identification keys the larvae were not determined to the species level. Larval identification was carried out by comparing their sequences with sequences available in databases.

Описание этапа методики:

  1. Total genomic DNA was isolated from the tissues of one to three legs of adults and larvae using the GenElute Mammalian Genomic DNA Miniprep Kit. Chromatograms were analyzed and edited in Geneious Prime. Misread nucleotides were manually corrected. The presence of stop codons in all sequences was checked using Mesquite. Poor quality sequences and those containing stop codons were excluded from further analyses. For phylogeographic analyses, we selected species with a broader distribution and a larger number of COI sequences available in the BOLD and GenBank databases.
Данные коллекции
Название коллекции Collection Plecoptera Sivec&Hlebec
Методы сохранения образцов Alcohol
Единицы хранения Между 488 и 512 vial
Дополнительные метаданные
Альтернативные идентификаторы https://ipt.pensoft.net/resource?r=croplm